Výhody polyakrylamidovej gélovej elektroforézy (PAGE) zahŕňajú najmä tieto aspekty:
Malý elektroosmotický efekt: Polyakrylamidový gél je syntetická látka s malým elektroosmotickým účinkom a nie je ľahké interagovať so vzorkou, čo pomáha znižovať deformáciu a difúziu vzorky počas elektroforézy.
Nastaviteľná veľkosť pórov : Koncentráciu monomérov možno pred polymerizáciou upraviť tak, aby sa vytvorili rôzne stupne zosieťovaných{0}}štruktúr, čím sa zmení poréznosť gélu. Táto flexibilita umožňuje polyakrylamidovému gélu vybrať vhodné gélové zložky podľa veľkosti molekuly separovanej látky, čo nielen zaisťuje separačný efekt, ale má aj dobré mechanické vlastnosti.
Tepelná stabilita: V určitom koncentračnom rozsahu je polyakrylamidový gél tepelne stabilný a gél je bezfarebný a priehľadný, ľahko sa pozoruje a deteguje.
Dobrý separačný efekt : Polyakrylamidový gél má malú veľkosť pórov a je obzvlášť vhodný na separáciu veľkých polynukleotidových fragmentov DNA alebo RNA a menších proteínov. Táto vlastnosť mu umožňuje dobre vykonávať separáciu zložitých vzoriek a zlepšuje rozlíšenie elektroforézy.
Menej znečistenia: Akrylamid je relatívne čistá zlúčenina a môže sa rafinovať, aby sa znížilo znečistenie, čo pomáha udržiavať presnosť experimentálnych výsledkov.